MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 135674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016946	GCC	2	6	87	92	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
2	NC_016946	CAC	2	6	98	103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744721
3	NC_016946	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
4	NC_016946	TCG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744721
5	NC_016946	CTG	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744721
6	NC_016946	AGC	2	6	198	203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
7	NC_016946	GCC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
8	NC_016946	ACA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744721
9	NC_016946	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
10	NC_016946	CGG	2	6	340	345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744721
11	NC_016946	CGA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
12	NC_016946	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
13	NC_016946	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
14	NC_016946	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
15	NC_016946	CCG	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
16	NC_016946	CG	3	6	606	611	0 %	0 %	50 %	50 %	379744721
17	NC_016946	TGC	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744721
18	NC_016946	CGC	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
19	NC_016946	TCA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744721
20	NC_016946	CGA	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
21	NC_016946	CGACGT	2	12	800	811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379744721
22	NC_016946	GCT	2	6	812	817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744721
23	NC_016946	CGA	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
24	NC_016946	AAGG	2	8	846	853	50 %	0 %	50 %	0 %	379744721
25	NC_016946	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744721
26	NC_016946	CAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744721
27	NC_016946	GCC	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
28	NC_016946	AGC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
29	NC_016946	CGA	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
30	NC_016946	CAG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744721
31	NC_016946	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744721
32	NC_016946	GCC	2	6	1263	1268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
33	NC_016946	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744721
34	NC_016946	ACC	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744721
35	NC_016946	GAA	2	6	1296	1301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744721
36	NC_016946	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379744721
37	NC_016946	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379744721
38	NC_016946	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744721
39	NC_016946	CAC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744721
40	NC_016946	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
41	NC_016946	GTGG	2	8	2151	2158	0 %	25 %	75 %	0 %	379744722
42	NC_016946	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744722
43	NC_016946	CGGTGC	2	12	2183	2194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379744722
44	NC_016946	TGC	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744722
45	NC_016946	CGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
46	NC_016946	CCG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744722
47	NC_016946	GAC	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
48	NC_016946	GGT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744722
49	NC_016946	GCC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744722
50	NC_016946	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744722
51	NC_016946	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744722
52	NC_016946	GCA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
53	NC_016946	GCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744722
54	NC_016946	GCCG	2	8	2865	2872	0 %	0 %	50 %	50 %	379744722
55	NC_016946	CCG	2	6	2879	2884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744722
56	NC_016946	CGA	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
57	NC_016946	CGA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
58	NC_016946	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379744722
59	NC_016946	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744722
60	NC_016946	CGAT	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	379744722
61	NC_016946	ACG	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
62	NC_016946	GAC	3	9	3178	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744722
63	NC_016946	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379744722
64	NC_016946	CCGA	2	8	3223	3230	25 %	0 %	25 %	50 %	379744722
65	NC_016946	GCC	2	6	3463	3468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
66	NC_016946	ACG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
67	NC_016946	CGC	2	6	3531	3536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
68	NC_016946	GGGC	2	8	3538	3545	0 %	0 %	75 %	25 %	379744723
69	NC_016946	GCA	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
70	NC_016946	GC	3	6	3606	3611	0 %	0 %	50 %	50 %	379744723
71	NC_016946	GTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744723
72	NC_016946	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744723
73	NC_016946	CGC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
74	NC_016946	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
75	NC_016946	CGGC	2	8	3700	3707	0 %	0 %	50 %	50 %	379744723
76	NC_016946	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744723
77	NC_016946	GTGC	2	8	3718	3725	0 %	25 %	50 %	25 %	379744723
78	NC_016946	TGC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744723
79	NC_016946	GC	3	6	3779	3784	0 %	0 %	50 %	50 %	379744723
80	NC_016946	CTG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744723
81	NC_016946	CGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
82	NC_016946	CGG	2	6	3999	4004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744723
83	NC_016946	GGTC	2	8	4086	4093	0 %	25 %	50 %	25 %	379744723
84	NC_016946	GAC	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
85	NC_016946	GCCA	2	8	4147	4154	25 %	0 %	25 %	50 %	379744723
86	NC_016946	CGC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
87	NC_016946	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	379744723
88	NC_016946	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
89	NC_016946	GTT	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744723
90	NC_016946	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744723
91	NC_016946	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379744723
92	NC_016946	CCG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744723
93	NC_016946	GTC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744723
94	NC_016946	CGG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744723
95	NC_016946	GC	3	6	4419	4424	0 %	0 %	50 %	50 %	379744723
96	NC_016946	CGG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744724
97	NC_016946	GAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379744724
98	NC_016946	GCG	3	9	4524	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744724
99	NC_016946	CG	4	8	4531	4538	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
100	NC_016946	GCCG	2	8	4551	4558	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
101	NC_016946	CG	3	6	4563	4568	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
102	NC_016946	GTC	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744724
103	NC_016946	GCG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744724
104	NC_016946	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
105	NC_016946	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744724
106	NC_016946	CCA	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744724
107	NC_016946	GAT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744724
108	NC_016946	GTT	2	6	4853	4858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744724
109	NC_016946	CGC	3	9	4868	4876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744724
110	NC_016946	GTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744724
111	NC_016946	GCCG	2	8	4916	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
112	NC_016946	CGT	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744724
113	NC_016946	CG	3	6	4969	4974	0 %	0 %	50 %	50 %	379744724
114	NC_016946	AGA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744725
115	NC_016946	CAC	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744725
116	NC_016946	GGT	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744725
117	NC_016946	CGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744725
118	NC_016946	CAA	2	6	5431	5436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744725
119	NC_016946	CGA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744725
120	NC_016946	CGT	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744725
121	NC_016946	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
122	NC_016946	CGG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
123	NC_016946	GCG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
124	NC_016946	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744725
125	NC_016946	CCA	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744725
126	NC_016946	CAC	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744725
127	NC_016946	ACC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744725
128	NC_016946	GC	3	6	5822	5827	0 %	0 %	50 %	50 %	379744725
129	NC_016946	CAA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744725
130	NC_016946	CGA	2	6	5878	5883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744725
131	NC_016946	GAG	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379744725
132	NC_016946	GTC	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744725
133	NC_016946	GTC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744725
134	NC_016946	CCG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744725
135	NC_016946	GGC	2	6	5959	5964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
136	NC_016946	GCACC	2	10	5992	6001	20 %	0 %	20 %	60 %	379744725
137	NC_016946	CGG	2	6	6013	6018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
138	NC_016946	CAG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744725
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141	NC_016946	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744725
142	NC_016946	GC	3	6	6216	6221	0 %	0 %	50 %	50 %	379744725
143	NC_016946	GGT	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744725
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154	NC_016946	GGGC	2	8	6556	6563	0 %	0 %	75 %	25 %	379744725
155	NC_016946	TGG	2	6	6621	6626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744725
156	NC_016946	CGGC	2	8	6636	6643	0 %	0 %	50 %	50 %	379744725
157	NC_016946	ATC	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744725
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159	NC_016946	CAT	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744725
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166	NC_016946	AAG	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744725
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168	NC_016946	GAC	2	6	7061	7066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744725
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176	NC_016946	GAC	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744726
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186	NC_016946	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744726
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247	NC_016946	ATC	2	6	10085	10090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744726
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249	NC_016946	ACG	2	6	10110	10115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744726
250	NC_016946	TCGC	2	8	10125	10132	0 %	25 %	25 %	50 %	379744726
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254	NC_016946	CTT	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744726
255	NC_016946	TTC	2	6	10298	10303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744726
256	NC_016946	CG	4	8	10363	10370	0 %	0 %	50 %	50 %	379744726
257	NC_016946	CTG	2	6	10388	10393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744726
258	NC_016946	GAG	2	6	10406	10411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379744726
259	NC_016946	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744726
260	NC_016946	ACG	2	6	10560	10565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744726
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262	NC_016946	CGA	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744726
263	NC_016946	CTG	3	9	10604	10612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744726
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388	NC_016946	TTC	2	6	16527	16532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744733
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